(註：這份資料多參考「中國教會知多少」，香港：證道出版社，1988。)
635年 唐太宗年間景教(涅斯多流派)開始傳入中國。
781年 [大秦景教流行中國碑]於長安建立。
879年 唐末因「黃巢之亂」，景教受牽連者眾，從此一蹶不振。
1279年 景教(也裏可溫教)隨蒙古人統治中國而再次傳入。
1289年 天主教方濟各會傳教士孟德高維諾抵華。
1583年 天主教傳教士利瑪竇、羅明堅抵華。
1610-1630年 徐光啟、李之藻、楊廷筠被稱為「中國天主教會三柱石」。
1633年 天主教道明會、方濟各會入華，同時引發起禮儀之爭。
1689年 俄國東正教傳入中國。
1807年 基督教傳教士馬禮遜來華。
1822年 馬士曼新舊約全書中文譯本在塞蘭坡出版。
1823年 馬禮遜新舊約全書中文譯本在馬六甲出版。
1827年 中國傳道人梁發按立為第一位中國牧師。
1842年 南京條約簽訂，外國傳教士可在中國沿岸五個港口範圍內自由傳道，歐美差會紛紛派傳教士來華。
1858及1860年 先後簽訂天津及北京條約，中國的宣教工作進入拓展時期。除西教士外，中國本地的傳道人同工也開始被培育，佈道工作成了這時期的首要工作。
1865年 戴德生離中國傳道會，創立中國內地會。
1877年 教會與差會在中國召開第一次全國傳教大會。
1887年 李提摩太成立廣學會。
1890年 召開第二次全國傳教大會，全國有宣教士1296名，華籍傳道人也有1657名。
1890-1911年 國人深感國勢日弱，對中國傳統文化產生懷疑，轉而開始對西方文明感興趣，教會在東北、河南、河北、由東、由西、或沿岸的福州、蘇州、上海等地都有復興，由區曲族更有群體歸主的現象，加上西方興起學生運動，有「劍橋七傑」等眾多宣教士來華。
1911年 中華民國成立、基督教擁有合法的地位、福音更興旺。
1911-1919年 中國教會的自立時期，華中有「中國耶穌教自立會」運動，華北有「中華基督教會」的自立運動。
1917年 魏保羅及張靈生等於北京創立「真耶穌教會」。
1918年 華人教會領袖發起「中華國內佈道會」，是第一個華人自組的差傳會。
1919年 國語和合本譯本新舊約全書出版。
1920年 石美玉及胡遵理創立「伯特利教會」。
1921年 中國共產黨成立；
敬奠瀛於山東馬莊創立「耶穌家庭」教會。
1922 倪柝聲等在福州開始創立「家庭聚會所」。並積極推行本色化運動。
1922-27年 非基督教同盟運動。
1923-27年 針對教會學校的收回教育權運動。
1930年代 教會間更重視彼此的團結合一和「本色化」，倡議及強調自治、自養及自傳(三自)。
1936-1949年 經歷了中日戰爭及國共內戰，但信徒卻越發增添，由五十三萬(536689人)(1936年)增至八十三萬(834909人)(1949年)，總增長率達百分之五十六(56%)。
1949年始 6月28日 中國基督教協進會在上海開會，青年會吳耀宗報告較早時他在北京與中共領袖會商的情況。
9月21日 中國人民政治協商會議(政協會議)在北京召開，宗教團體有派代表參加，其中5人為基督徒，分別為吳耀宗、趙紫宸、鄧裕志、劉良模及張雪岩。
9月29日 政協會議議決接納「共同綱領」，其中第五條明列保證人民有宗教信仰的自由。
10月1日 中國人民共和國成立。
10月25至27日中國基督教協進會執委會議在上海舉行，趙紫宸提出動議要自養和自治。
10月10日 協進會發出「給全國基督徒的第三封信」，表示中國已進入了一個歷史新紀元。
1950年 5月2日 以吳耀宗為首的19位基督教領袖與周恩來在北京開會，主題圍繞教會如何有效地支援政府，結果草擬了「基督教宣言」。
6月13日 上海《解放日報》發表「控訴美帝國主義利用基督侵略中國之罪行」一文，兩星期後韓戰爆發。
6月30日 一群宣教士及基督教領袖受邀到上海青年會聆聽吳耀宗報告及與政府會商的情況。「中華人民共和國土地法」公佈，全面展開「土改運動」。
7月5日 聖公會主教發表「教牧書信」，否認教會與帝國主義有關連。7月28日《基督教宣言》正式發表，題目全名為《中國基督教在新中國建設中努力的途徑》，內容主要針對帝國主義對基督教的影響、擁護《共同綱領》、教會接受政府領導及進行改草等。
7月30日 《人民日報》發表了「基督教人士的愛國運動」重要社論。
9月23日 「基督教宣言」在《人民日報》上發表，並刊登1500多人表示支援該宣言的基督教領袖名單。
10月18-25日中國基督教協進會在上海召開第一屆年會；議決支援「基督教宣言」在並促請各教會實行「三自」。會議籲請各宗派合組一個中國聯合教會，同時又號召信徒擁護「土改」。
10月25日 中國人民志願軍介入韓戰。
11月 開始驅逐宣教士。
11月2日 《人民日報》報導「五年內完成三自運動促進委員會」的成立。
11月15日 上海宗教界召開抗美援朝大會。
11月24日 《人民日報》轉載了「對天主教基督教問題應有的認識」一文，指出「為了社會秩序的安定，合理的辦法應該是教會不去教堂以外傳教。」
12月 教會學校開始進行控訴美帝運動。
12月29日 政務院第六十五次會議通過了「處理接受美國津貼的文化、教育、救濟及宗教團體的政策決議」。
12月下旬 約十萬人(98596人)在「基督教宣言」上簽名。
1951年 1月 內地會決定撤走傳教士和家眷，共計601名成人，284名兒童。
2月12日 基督教燕京大學由政府接管。其他基督教學校亦陸續被接管。
2月21日 中華基督教會函告名國宣教團體，告知因國內情況及政務院決議，該會決定停止接受外國任何金錢援助。
4月16至21日
上海宗教事務處召開「處理接受美國津貼的基督教團體會議」，有151位基督教領袖參加。會議發表了「聯合宣言」及組成「中國基督教抗美援朝三自革新運動委員會籌委會」。
4月24日 《人民日報》社論呼籲要展開對美國帝國主義的控訴。
5月15日 青年會幹事劉良模發表「怎樣開好控訴會」一文。自此，中國大陸報章及《天風》發表了一連串對「反動」基督教領袖的控訴文章。
6月10日 第一個大規模的控訴會在上海舉行，約有一萬二千人參加。
7月8日 中、美、北韓開始停戰談判。
7月12日 趙紫宸辭去世界基督教協會主席之職。
天津救世軍被禁止活動。
8月4日 195名基督教出版人士在上海開會自我檢討，承認在基督教文字中有帝國主義毒素。
9月10日 上海市人民政府發通告表示願意幫助各教會實行三自，凡已進行三自之教會可以申請減免稅項。
11月1至21日上海舉行基督教政治學習班。
12月 全國展開各貪汙、反浪費、反官僚主義的「三反運動」。
1952年 4月 毛澤東結束「三反」，又展開針對工界進行行賄、反偷稅漏稅、反盜竊國家資財、反偷工減料、反盜竊經濟情報的「五反運動」。倪柝聲在「五反運動」中被捕。
1953年 7月27日 韓戰結束。
1954年 7月22至8日「第一屆中國基督教全國會議」在北京召開，出席者包括232名來自62個不同教會團體的代表。會上吳耀宗報告過去四年三自運動的情況。「三自革新運動」改名為「三自愛國運動」，「中國基督教三自愛國委員會」正式成立，並由吳耀宗出任主席。與會人士希望爭取王明道支援「三自愛國運動」，但無效用。
12月2至12日青年會全國會議在北京舉行，吳耀宗向來26省市的23名代表報告5年來的發展。
1955年 7月9日 王明道在《靈食季刊》發表文章，闡明他對三自運動的態度是本於「信和不信，不能同負一軛」的基礎。
7月21日 《天風》發表一篇6頁長的文章，號召教會及基督徒控訴王明道拒絕參加三自運動。自此，一連串控訴運動在全國各地舉行。
8月7日 王明道講道，題為「人子被賣在罪人手裏了」。他翌日被捕。
10月 有當局宣佈三自運動範圍以外的任何基督教活動為非法，並號召全國基督徒參加社會主義的建設與改造。
1956年 1月29日 有關當局宣佈破獲「倪柝聲反革命集團」。
1月30日 上海宗教事務處召開控訴「倪柝聲反革命集團」大會。
2月4日 《浙江日報》社論宣稱要肅清潛在基督徒聚會處的反革命分子。
3月15至23日
中國三自會第二次擴大會議舉行，269人出席。吳耀宗指出中國教會已經和外國差會割斷關係而由中國籍人士管理，所以中國教會史已合一。
4月 基督徒聚會處改組並正式加入三自運動。
5月 聖公會主教在上海開會並發表一封「教牧書信」，嘉許6年來三自運動的工作及教會的政治覺醒，又籲請共產黨員對基督徒採較同情的態度。
9月30日 王明道獲釋，並發表自我檢討。後又否定其檢討內容，於1958年4月再次入獄。
12月5日 廣學會、中華浸會書局，中國主日學協會及青年協會書局組成「中國基督教聯合書局」。
1957年 2月27日 毛澤東主持召開了最高國務會議，就有關正確處理人民內部矛盾的問題作出了報告。「整風運動」開始。
6月8日 《人民日報》發表「這是為甚麼」的社論，號召開展反右派鬥爭。
6月10日 全國三自會號召全國信徒積極參加反右運動。
10月28日 中國三自會第十次全國擴大會議在北京召開。會議指控自由傳道是反共、反社會主義的。與會153人接受再教育和學習如何去揭發教會中右傾思想。三自常委會議聯合發表言論，指陳崇桂政協會議發言是反黨反共，誣蘇崇美，詆毀三自的言論，其後陳氏被判勞改6年。
1958年 8月30日 中共中央委員會政治局在河北舉行擴大會議，通過了關於在農村建立人民公社問題的決議。至此，大躍進，總路線，人民公社的「三面紅旗」政策推出。
10至11月 全國各地教會合併，上海200所教會合併為15所，北京64所合併為4所。
11月10日 以吳耀宗為首的10位基督教領袖發表聲明，號召要加強反帝愛國運動，清除殘餘的反動分子。
1959年 5月 《天風》對《荒漠甘泉》一書進行批判。
9月26日 吳耀宗為國慶獻辭，是為「基督教在新中國」。
1960年 11月12日 中國基督教第二次全國會議在上海舉行，會期直至1961年1月14日。會議強調要為中國的社會主義建設服務，必須繼續進行思想改造和加強揭發所有非法活動。
1961年 7月 《天風》對兒童主日學進行批判。
1962年 4月18日 《解放軍報》發表社論「高舉毛澤東思想偉大紅旗積極參加社會主義文化大革命」。
6月1日 《人民日報》發表社論「橫掃一切牛鬼蛇神」，全國各地學生掀起「造反運動」。
8月 北京紅衛兵關閉、搗毀教會，焚燒聖經及屬靈書籍，信徒被侮辱。此行動迅速蔓延至全國。
8月8日 中共中央發表「關於無產階級文化大革會的決定」(即十六條)。
12月 公開的聖誕崇拜禁止。紅衛兵進入各大城市展開文化大革命。
1967年 4月 復活節崇拜被禁。
1971年 4月 國務院宗教事務局恢復部分活動，安排外賓參加宗教活動。美國乒乓隊訪問中國大陸，一隊員報告說他看不到任何基督教跡象和基督徒。
8月3日 一些曾在勞改營勞改的牧師和傳道人被派回廣州負責接待外國訪問的宗教人士。
1972年 1月 在北京恢復有專為外交人員而設的主日彌撒。
12月 外僑在北京慶祝聖誕。
1975年 1月17日 中共通過新憲法，第二十八條列明公民「有信仰宗教的自由和不信仰宗教，宣傳無神論的自由」。
1976年 2月 加拿大長老會的E. H. Johnston訪問中國大陸，會見丁光訓。丁說南京神學院仍有12名教授，8名助教，都是由各三自機構支援的，他們正在學習無產階級專政的政治課。他並說基督教已非專業化，基督徒聚會通常不在星期日，也不在教堂舉行。
1977年 3月 國務院宗教事務局恢復進行各方面工作。
8月8日 加拿大基督教會中國研究計劃主任，應中國對外友好協會邀請訪問中國大陸一個月。
9月27日 《人民日報》發表「研究宗教，批判神學」一文，作者任繼愈，重申「宗教是人民的鴉片」，並「深入揭露宗教神學用以論證教義的種種謬論」。
10月27日 全國四屆人大常委會議中，葉劍英提出要正確執行宗教政策。
1978年 2月 全國宗教學研究會議在昆明舉行，成立了中國宗教學學會，且留下3至5席位給港澳代表。
3月1日 16名宗教人士參加第五屆政協。
4月10日 首次宗教學研究規定座談會在北京舉行，主張用馬克斯主義觀點研究教會歷史。
12月30日 中國無神論學會成立，其目的要「繼承歷史上無神論思想，推動無神論研究」。
1979年 1月 南京大學宗教研究所成立，目的為從宗教的歷史和現狀出發，對宗教進行實事求是的研究。
2月 全國首次宗教學研究規畫會議，制定8年全國宗教學研究計劃。
4月9日 寧波教會重開，為文革後第一間重開教會。
6月4-6日 上海三自召開第三屆委員會第三次會議，恢復組織。
7月 海外一基督教機構秘密私運超過一百萬本聖經進入中國。
8月29日 中國宗教代表團出席世界宗教和平會議第三屆大會，丁光訓是團員之一。
9月2日 上海沐恩堂恢復崇拜。
9月17日 中國三自會主席吳耀宗病逝，年八十六歲。
9月30日 廣州東山堂重開。
1980年 1月9日 王明道獲釋，返回上海居所。
2月25-1日 中國三自會常委會擴大會議在上海舉行，有來自16省市的37人參加。會議肯定三自政策；決定重印聖經，印行讚美詩和屬靈書籍；恢復出版《天風》；促神學院復課；籌組全國的教務機構，並發表「告全國主內弟兄姊妹書」。
3月8日 上海舉行十年來第一次基督教婚禮儀式。新娘為英國人，新郎為美國人。
4月4日 福州市在1979年底開放的教堂慶祝復活節，為文革以來首次。
10月6-13日中國基督教第三屆全國會在南京舉行，來自各地的176名代表，肯定三自運動政策和原則，成立全國性教會機構，命名「中國基督教協會」。它和三自會分工合作，主要任務為教牧工作，栽培傳道人，出版聖經靈修書刊，加強與各地教會和信徒的聯絡。
10月20日 《天風》覆刊。
12月 南京金陵協和神學院函授科編印神學課程函授教材，印數一萬份。
12月6日 中華基督教青年會全國協會、中華基督教女青年會全國協會、上海基督教青年會及上海基督教女青年會聯合在上海青年會禮堂舉行茶會、宣佈青年會正式恢復活動，有150多人參加。
12月23日 丁光訓發表「十四點看法」，闡釋了三自會在對外關係上的原則。
1981年 2月28日 南京金陵協和神學院開課，共有47名學生。
3月-4月 全國三自會及中國基督教協會派出8人代表團訪港，出席「亞洲基督徒見證諮詢會議」，並與港教會人士接觸及研討。
4月 「真道號」福音船(M.V.Logos)訪問上海15天，部分船員參加公開教會崇拜。
5月5日 福建三自會開辦「義工進修班」，自此，其他地區亦相繼舉辦。
6月18日 加拿大基督教聯合會代表團17人應三自會的邀請，赴中國作18天訪問。
9月12-21日香港教會團體領袖18人應中國基督教協會邀請訪問內地，行程包括上海、南京、北京及廣州。
10月2日 中國基督教7名代表與另3名中國天主教代表同往加拿大蒙特利爾，參加由加拿大基督教協會主辦的國際會議「新的開端」。
12月14日 據新華社報導，中共官員說反動的名國傳教士和「反革命分子」已滲透到中國大陸重新活動的教堂。
12月12-30日
美國基督教協進會代表團一行16人應中國三自會及全國基督教協會之邀請訪問大陸。
1982年 1月8日 英國坎特伯雷大主教一行3人應丁光訓邀請到南京作私人訪問。
3月29日 雲南省三自會和基督教協會通過「關於維護正常宗教活動的決定」，據報類似的文件在其他地區也有頒佈。
4月27日 澳洲基督教協會訪問團低北京訪問。
8月 雲南省三自會要求家庭教會登記，同時解散140處聚會點。
9月19-24日三自、基協常委擴大會議在北京召開，聽取統戰部及宗教事務局講述宗教政策，並肯定了「定片、定點、定人」的「三定政策」。
10月 丁光訓訪歐時表示，中國有基督徒200至300萬。
12月4日 五屆人大五次會議通過新憲法，其中第三十六條，有「信仰宗教自由」修款。
12月5日 廣州三自會發佈「關於擁護市人民政府宗教事務處，制止林獻羔違法活動的口頭宣傳資料」，在林獻羔家中舉行的崇拜聚會隨即停止。
1983年 5月5日 全國兩會在上海召開會議，討論「堅決抵制李常受的異端邪說」。稍後宗教事務局發出通知，要求各地抵制李常受的呼喊派，呼喊派負責人大量被捕。
7月13日 福建神學院招生40人。
1984年 3月12-6日 由丁光訓、韓文藻率領的中國基督教代表團，一行11人經香港前往澳洲及新西蘭訪問。
4月-5月 雲南出版曲文《新約全書》第一版一萬冊，僳僳文聖經一萬五千本。
5月20日 丁光訓在第六屆人大二次會議記者招待會中透露，全國有1600間基督教堂和300萬基督徒。
8月2-8日 全國兩會常務會議在北京舉行，達成決議包括：
1. 撤換三自會極左分子，即所謂「一貫正確」人物；
2. 強調各地統戰及宗教部門幹部要吃透宗教政策；
3. 要擴大團結面(就是不明道理也要團結)；
4. 教會要向外開放(引進國外親友的技術和資金)。
8月5日 中共中央統戰部長楊靜仁在三自三十周年慶祝會上講話，指責海外福音廣播工作及反華勢力。
9月5-9日 人大常委會副委員長姬鵬飛及國務院宗教事務局代局長任務之接見香港基督教領袖，透露「三互」政策。
9月7日 中華基督教青年會全國協會副會長，基協副會長江文漢逝世。
《金陵協和神學誌》覆刊。
11月11日 德蘭修女獲全國兩會邀請，訪問中國。
12月23日 香港《基督教週報》報導：三自會蔡文浩牧師稱全國已印刷聖經130萬本；《讚美詩新編》25萬本。
1985年 1月 據《中共問題資料雙週》第141期報導，中共內部傳達「宗教七禁」。內容包括：1. 禁止家庭聚會；2. 禁此秘密祈禱；3. 禁止政治涉入；4. 禁止跨縣傳教、講道；5. 禁止與外國教會秘密聯繫；6. 禁止私自轉讓聖經書籍；7. 禁止私建教堂。
2月18日 《光明日報》表「正確理解社會主義時期的宗教問題」的文章。
3月5日 上海華東神學院成立。
3月22日 丁光訓接受香港一份基督教刊物訪問時稱，政府無壓迫家庭教會，並表示兩年內中國將成立聯合教會。
4月10日 宗教事務局局長任務之表示香港宣教士不得入內地傳教。
4月19日 愛德基金會在南京成立，丁光訓為董事長。
5月 江蘇省兩會印行《關於教會按立聖職、受洗、經濟管理的條例》。
6月5日 南京金陵協和神學院重開後首屆畢業生95名。
7月2日 福建神學院重開後首屆畢業神學生60名。
7月3日 1960年以反革命叛國罪被判無期徒刑的天主教上海主教襲品梅獲准假釋出獄。
7月14－27日
南京金陵協和神學院舉行40年來首次基督教研討會，主題為「在中國為基督作見證」，有200人參加。
8月16－23日
全國神學教育座談會在浙江莫干山舉行。會上提出目前神學教育困難包括：1. 選苗問題；2. 師資缺乏；3. 課程問題；4. 管理問題。
9月12日 浙江神學院開課。
10月27日 丁光訓指出全國開放及新建教堂已達4000間，聚會點則有3萬多個。
11月 《人民日報》海外版刊登趙復三篇文章：「對宗教需要有更科學全面的認識」。
1986年 4月1日 國務院宗教事務局局長任務之等4人代表團訪問香港。
4月－5月 上海宗教事務局召開會議，邀請家庭教會負責人參加。第一天會上宣佈此會議由政府宗教部門召開，非三自召開。第二天，編排小組時發現，每組均有三自成員，討論內容集中於參加三自的好處與不參加的弊點。會議成期15天。
《基督教週報》報導，《天路歷程》中文譯本在上海發行20萬本，3天內即告售光！
7月5日 一個名為「天父的兒女」邪教組織滲透內地大專院校，利用色情刊物及賣淫等方式吸收青年成員。據中國警方透露，已捕獲該組織119名成員。
8月 南非聖公會大主教杜圖到華訪問。
8月16－２3日
中國基督教第四屆全國會議在北京召開。會議報告指出內地教堂超過4000所，神學院10所，基督徒3000萬人，神職人員6000人。丁光訓連任三自主席及基協會長。
9月 北京燕京神學院成立，學制分初(1年)、中(2年)、高(4年)3種。
9月25日 廣東協和神學院覆校。
1987年 1月16日 山西省基督教第一屆代表會議通過「開於堅持正常宗教活動的九項守則」，嚴格執行地方上宗教政策。具體規定包括：「未經政府有關部門批准的宣傳品，應及時上繳或拒絕接受」、「抵制以傳福音為名進行的醫病趕鬼等非法活動」、「講道應積極地引導信徒愛國愛教」等。
1月21日 江蘇省兩會召開會議，通報1987年工作包括：為杜絕「自由傳道」亂講傳、趕鬼醫病、騙取錢財、造成混亂，省兩會擬深入基層教會作調查，先選個別縣作試點，試行頒發「傳道證」。
2月3日 全國兩會會務會議在杭州舉行，提到中國教會已從1980年的恢復階段，進入建設階段。要從恢復禮拜堂，轉移到以搞好教會自治、自養、自傳為主要任務。又強調農村教會工作重要性及提防海外反華命勢力的滲透。
3月 宗教事務局局長任務之重申：堅持四項基本原則，並不要求宗教信徒放棄他們的信仰，只要求他們不進行反對馬列主義、毛澤東思想的宣傳。又要求宗教不得幹預政治、司法和教育。
5月初 美國聯會衛理公會中國小組主任高恩牧師赴京訪問丁光訓，談及中國教會與香港教會問題。丁光訓指出：香港任何團體針對大陸進行傳教運動，是違反中英聯會聲明的。
5月12日 據報導，安徽某男子聲稱某月某日，「天堂遊船」降臨，並招募農民在河邊等候。結果「天堂遊船」遲遲沒有出現，6名農民便投下海中溺斃。
5月下旬 繼「天父的兒女」活躍於內地大專院校，又有外星人教派的傳道人在活動。一名男子自稱是外星人後裔，赴北京宣稱他進行了十年的「雷爾運動」，即迎接造物主耶路西外星人降臨的運動。
6月 國務院發出《關於嚴厲打擊非法出版活動的通知》，決定在全國範圍內開展打擊非法出版活動，主要以針對黃色書刊及迷信刊物為主。某些家庭教會因私自印刷屬靈小冊而遭查禁。
6月25日 廣州市人民政府辦公廳頒定《廣州市宗教事務行政管理暫行規定》，共6條，於7月1日開始實施。
9月 南京愛德印刷廠開始印刷聖經。
全國基協統計，中國有教會4044所，聚會點16868個，信徒3，386，611人，同工4574人，神學院11間。
10月 山東神學院成立，成為中國大陸第十一間神學院。
1988年 1月5日 天主教上海教區原主教襲品梅正式獲法院裁定，減免剩餘的假釋考驗期，並恢復政治權利。
3月 陝西基督教聖經學校成立，為中國大陸第十二神學院校。
4月 國務院宗教法進行座談，整理成「國務院宗教法起草小組的報告」。
4至8月 廣州市包括林獻羔主持的大馬站教會在內約33個家庭聚會點接獲警告，要求各聚會點必須加入三自會，否則便要停止聚會。
4月13日 葛培理應「對外友好協會」和「基協」的邀請，往北京、南京、上海、廣州作為期兩週的訪問。
4月24日 據報導，河南家庭教會傳道人徐永澤，在北京月壇公園被捕。徐氏前往北京原是希望會晤正在中國訪問的葛培理，卻於途中被捕。
6月26日 孫彥理和沈以藩在上海沐恩堂被按立為主教。此為中國基督教會30多年來首次按立新主教。
10月 丁光訓與汪維藩聯名發展中國統戰理論研究會論文「近幾年宗教研究上若干突破」專文，以因應大陸社會科學界日趨活躍的宗教研究。
12月 全國兩會發表的統計數字顯示，至1988年底內地有教堂6375所，聚會點20，602處，信徒4，551，981人，同工12，060人，神學生711人。
1989年 3月5日 第一所東正教堂於黑龍江省哈爾濱市正式開放。
5月18日 中國基督教兩會出席第二屆洛桑會議。有條件地邀請三自會及家庭教會出席第二屆洛桑會議為注入宗教對立，是分裂中國教會及違反中國憲法的行為。
針對學生在北京的絕食示威行動，丁光訓發表了「我們基督教界聲授學生愛國行動」的聲明，並稱基督徒也參加示威遊行。
5月24-25日
兩會在上海的政協委員及常致函全國人大及政府，呼籲召開緊急會議，解決學生及人民的愛國民主運動。
6月4日 解放軍鎮壓在北京示威的民眾，當局大力逮捕民運分子。
6月9日 全國三自會副主席趙復三在巴黎出席聯合國教科文會議後，因曾表態支援學運而決定不回國。
6月20日 中國天主教愛國會，天主教教務委員會召開會議，表示完全擁護第十三屆四中全會的各項決議，即武力處理天安門事，推舉江澤民取代趙紫陽任黨總書記的會議決定。
6月27日 全國三自及基協發表聲明，擁護第十三屆四中全會之決定。多個省市兩會亦表示支援平息「反革命暴亂」。
11月7日 全國兩會於上海舉行會務擴大會議，強調理順三自、基協及教會之關係，並設立四個委員會，出版三自運動文獻，設立神學教育基金，出版聖經及基督教文字。
1990年 9月 丁光訓主教在全國人民代表大會上發言，強調堅持「第19號文件」為宗教政策的基礎，反對以行政命令的手段幹預宗教活動。並把東歐政變與教會的關係歸結為民族問題並強調黨要落實民族和宗教政策，繼續進行向來取得成效的宗教統戰工作。
1991年 2月 中國基督教協會獲得世界基督教協會的會員資格。
6月 中共中央頒發「第6號文件」，加強對宗教活動的管理，提出所有宗教場所需登記，不允許境外團體幹預及進行傳教活動，而所有境外宗教團體的捐贈及訪問需由省級以上政府或宗教事務局批，以及明言黨員不得信教。
7月28日 王明道在上海病逝，安息主懷，享年九十一歲。
8月 中國教育部頒發一份關於防止宗教對學校教育影響的文件，指出要堅持宗教與教育分離的原則，並對宗教妨礙教育情況嚴重的地方，指出要在政府領導下進行綜合治理。
11月 國務院發表《中國人權狀況》白皮書，文中提及中國憲法保障人民享有宗教信仰自由，國家保護正常宗教活動的合法權益，並稱沒有信徒是因信教而被捕的。
1993年 9月3日 梵蒂岡代表紅衣主教埃及加雷抵達北京進行6天的訪問，他是57年中梵斷絕關係後首次訪華的梵蒂岡高級官員。
11月 中共總書記江澤民在全國統戰工作會議上發表有關「宗教與社會主義相適應」的講話，表示宗教人士要以支援黨及政府的領導作為大前題，接受法律的規範，努力發揮宗教人士對社會的積極性。
1994年 1月31日 中國總理李鵬簽署了兩項有關宗教的第144號及145法令，進一步限制境內宗教活動：禁止外國人在大陸傳教及要求所有宗教場所進行登記。
2月11日 7位外國人因反第144及145號法令，在河南省被拘留四天。
3至4月 大陸政府開始對犯罪活動進行「嚴打」，有些家庭聚會點也受到牽連，不少信徒被捕，聚會點被抄。據報導，上海市政府在三月要求國際基督教協會並在四月要求上海國際信徒會停止活動。
7月 當局進行的「嚴打」活動轉向針對「呼減派」，不少的呼喊派信徒被抓，同時，當局也要求家庭聚會點進行登記，而沒有登記的教會則被罰款，抄家，有些地區的信徒甚至被捕。
8月 據海外報導，北京家庭教會領袖，八十二歲的袁相忱，在不願向官方登記的情況下，自願停止有聚會點的家庭聚會。但後來信徒仍繼續到來聚會，公安也禁止不了。
8月7日 中國基督教協會副會長並總幹事，上海市基督教教務委員會副主席、全國政協第八屆委員，沈以藩主教，在山東因心藏病發去世，享年六十六歲。
1995年 2月 第一間由政府營辦的宗教出版社正式成立，名為「宗教文化出版社」，出版範圍包括宗教政策、宗教學理論、宗教歷史、文化研究及各類宗教經典等。
2月7日 上海當局拘捕了邪教組織「被立王」的首領吳揚明。他宣傳自己是「被立的王」，以自己為基督，姦淫婦女達百人，影響曾遍及數個省份。
11月6日 據海外報導，大陸有關部門下達了一份《關於進一步加強對宗教組織團體的領導和監督》的文件及《關於宗教組織、勢力在城市、農村活動情況》的調查報告，顯示大陸現有各種宗教信仰的教徒合共7，000多萬人，其中天主教及基督教信徒有2，500多萬人。報告指出教會在社會上已形成一股有形、無形的政治意識力量，並正在迅速發生作用。
1996年 1月14日 中國國務院國務委員司馬義，艾賈提在全國宗教局長會議上，列出對宗教活動所進行登記作為全年首要的宗教工作，並要著「抓重點、攻難點、解決熱點問題」，加強對宗教活動的規範。
6月 溫州有多位兒童主日學領袖被捕並被判多年勞改。
6月 廣東省一位年青牧師因為到其他縣去傳福音而被三自會組織禁止，後被掠奪牧師職份。
7月1日 由8間基督教出版機構組成的香港基督教出版聯會訪問團，到大陸探訪多間神學院及教會，並將1，000本屬靈書籍贈送予上海華東神學院，又於7月5日把近百本屬靈書籍贈送給南京金陸神學院。
9月 深圳有信徒領袖私自印刷屬靈書籍被抄家和拘留審問。
12月9日-97年1月2日
第六屆全國基督教會議在北京舉行，韓文藻發表《兩會工作聯合報告》，信徒人數由1994年500多萬，增長至1，000多萬；教會由七千多間發展至12，000多間；聚會點則由20，000個增加至25，000多個。另外，牧師人數約有1，000，其中800個是在1992年間按立的，而在17所神學院及培訓中心畢業的神學生約有2，700位。
1997年 1月 《天風》發表1980年至1996年12月31日期間，在大陸正式印刷及發行的各類聖經總達17，180，920冊。
1月3日 身兼三自會主席及基協會長的丁光訓主教正式退休。新的三自會主席為羅冠宗，基協會長為韓文藻。
4月2日 南京愛德印刷公司印製的各種版本聖經已經己達1，500萬冊。
7月7日 全國兩會負責人羅冠宗、韓文藻就海外對大陸基督教狀況的指責，在北京召開新聞發佈會，指出自1980年起大陸共發行印刷了聖經1，800萬冊；近十多年來已有3，200神學生畢業，目前在讀神學生共1，296人。
7月22日 美國國務院發表世界宗教報告，指責中國限制宗教自由並扣押河南教會領袖。
9月 《天風》雜誌發表《吳耀宗先生不容誣蔑》的評論員文章，點名批評香港建道學院梁家麟博士的《吳耀宗三論》一書。
10月16日 中國國務院新聞辦公室發表《中國的宗教信仰自由狀況》白皮書，白皮書強調宗教事務及團體不受外國勢力支配，反對藉宗教干涉內政，並稱無人因信教被懲處，政府不干涉團體內部事務。
10月17日 雲南有一著名家庭教會領袖被補。四個月後才被釋放。
11月4日 中國基督教協會會長韓文藻發表《致海外中國教會朋友們的公開信》，指責美國南浸會國際差傳部對中國採取「雙軌策略」，在中國大陸從事「傳教活動」。
11月5日 大陸愛德基金會在其出版物《Annity News Service》上報導大陸有基督徒1，000-1，400萬，牧師1，500名，其他全職教會事奉人員16，500人。
1998年 2月 國務院宗教局長葉小文和中國基協會長韓文藻及中國三自會秘書長鄧福村，應葛培理邀請到美國訪問。在此期間三位美國宗袖應江澤民的邀請受克林頓指派訪問中國大陸。
3月 中國自三會出版記念丁光訓九十歲誕生神學集。
丁光訓在人明日報發表文章指責年輕傳道人及神學院強調和傳講基督再回來的資訊。
4月 溫州有一家庭教會領袖因「在外地從事宗教活動」被抄家並扣留審問。後罰款二萬元釋放。
7月 美國克林頓總統訪華，並在北京崇文門教堂作禮拜。
北京家庭教會領袖袁相忱在一租用會場為信徒公開施洗而被捕。
12月26日 深圳有五百基督徒聚集慶祝聖誕節，在講道中被公安圍捕。一百一十人被登記，五位領袖被捉去問話並限制活動。
1999年 1月 陝西省多位家庭教會領袖因「有組織的宗教活動」而被捕。
5月 三自會要求各省教會領導人和教牧同工應著丁光訓的思想路線再學習，並表態神學立場。多位神學院老師和學生離去。
7月28日 中國政府宣佈「法輪功」為非法組織，是邪教，並全國捕捉法輪功領袖和禁止信徒練功。預計有數萬人被捕，多數被審問和罰款，然後放人。至九九年十二月止，香港星島日報報告預計有三千七百多人被送往勞改營接受思想改造。
7月 香港多份報紙報導一位多次被禁止到北京去的外省天主教神父到北京主領彌撒後被發現打死，屍體被丟棄街上。
8月 河南省有八位家庭教會領袖在聚會時被捕。
10月 吉林省一位家庭教會領袖因私下印刷屬靈書籍被補，被監九個月，後交還罰款三萬八千元得釋放。
11月 全國進行第二輪打擊法輪功活動。
11月 山東省有一家庭聚會點在聚會時，公安派三輛卡車把八十多位信徒載走。以對付法輪功邪教手法，每人罰款二百至六百元才放人。即使三自教會派代表來求情說這些信徒是基督教徒，還是無法解決，必須罰款才放人。
2000年 7月 河南方城靈恩派教會一百卅多人被公安拘補。後來繼續拘留一百零八人，其中有三位是台灣去的信徒。
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