當初亨利八世為要與妻子凱撒琳離婚，而與天主教決裂。凱撒琳是西班牙的公主，是最支持教皇的西班牙王查理五世的姑母，為此，教皇不肯批准亨利的離婚要求。而瑪利是凱撒琳的女兒，也是堅定的天主教徒，當愛德華逝世，依法她繼承王位，成為英國女王。
1. 血腥瑪利：
愛德華於1553年因肺病去世，年僅16歲；他同父異母的姊姊瑪利即位。瑪利沒有忘記母親和自己所受的屈辱，於是在登位後，便極力破壞改教運動，迫害改革派，並恢復天主教。她首先透過國會撤消愛德華改教的諭令，將改革派的主教全部撤職，代之以支援天主教的人。
然而，此時改革派的勢力已相當穩固，一時不容易對付。瑪利復辟心切，便使用暴力，不少人在她的手下慘死，也有不少要逃到日內瓦和法蘭福特。她使英國改教運動至少倒退了廿五年。所有國會在前王任內通過的法案，都被撤銷。凡贊成改教運動的主教或低級聖職人員，都被革職。她又大肆逼迫復原教徒，據估計，在她統治期間，英國各地至少有三百人被火燒死。許多改教領袖逃到歐洲大陸；克藍麥是愛德華時代《公禱書》與《四十二信條》的主要起草人。1555年，被革除教籍，並被迫公開承認教皇有權管轄英國教會，並簽署了一份否認復原教的宣言。
但他在1556年接受刑前，把以前所有翻供與否認的事全部撤銷，而以堅定的口氣宣告他的復原教信仰，終於被火燒死。現在牛津市中心的一座殉道紀念碑便是紀念他們的。由於瑪利主政時，殺害許多人，瑪利的高壓政策為她帶來一稱號「血腥瑪利(Bloody Mary)。瑪利於1558年，在位6年後去世，王位由她同父異母的妹妹伊利沙白繼承，英國的改教事業才得以繼續發展。
2. 伊利沙白：
改革人士以為終於有了盼望，他們希望身為新教徒的伊利沙白女王是一位尊重聖經的女性，豈知她登基後不久，情況的發展並不如改教者所預期的。
a.
1559年，即宣稱自己是英國教會的最高行政首領，於是教會不得不服在她的權下。
b.
1560年，提出教會統一條例，據此條例，英國只有一個教會，即聖公會，英國國教。
c.
1563年，伊利莎白下令教士平日需穿著特定服裝，引起了清教徒反對。他們認為信徒皆為祭司，不應有袍服的分別，同時也反對信徒跪領聖餐，以及洗禮中的十架手勢。
d.
1572年代，劍橋教授卡賴特在清教徒會議中，提出信徒平等論點，要求放棄主教制度，由信徒自行推選長老。這是對聖公會的主教權威發出挑戰，卡特賴特因此被開除教職，卻因而開始了英國長老會。同時，另外主張政教分離的清教徒，開始了公理會。
e.
1581年，布朗尼成立了第一個自由教會，主張教會應由真基督徒組成，並由信徒自行治理。面對分離主義的擴大，伊利莎白以統一教會為由，開始鎮壓清教徒。
f.
1593年，女王頒下御令，信徒不得私自聚集，一經查出，立即驅逐出境，假若他們潛返而被捕，則可判處死刑。為使全國教會統一於她的領導，伊利沙白不惜用最嚴厲手法。然而，壓迫越大，清教徒卻越發增加；不單如此，清教徒主義支持者在國會的數目也越來越多，造成日後清教徒主義與國會有很密切的關係。同時，流亡在海外的清教徒在歐洲建立起重要的據點〔特別是荷蘭〕，在那裡發展得非常快。
3. 詹姆斯一世：
伊利沙白死後，王位由蘇格蘭王詹姆斯六世繼任，到英國即位時，改王號為詹姆斯一世。詹姆斯在蘇格蘭時受盡蘇格蘭長老會中的教牧師領袖的氣〔蘇格蘭以長老會為國教〕，所以一到英國，馬上成為教會的首領，便得意忘形。為了表現他的威風，便向那些不肯俯首順服的清教徒施下馬威。英國的清教徒也估計錯誤，他們以為雅各一世既受長老會傳統的薰陶，一定會體諒他們，在1604年的一個議會中，聯名上書，請求簡化崇拜儀式，並修改公禱書的某部分。誰知詹姆斯不但不允許他們的請求，反而嚴厲地斥責他們，要他們順服於英王及主教的領導，並下令將三百名教牧人員革職，任何不依循國教的規定舉行崇拜的人，便受嚴重的處分。
至此，和解的希望似乎幻滅，而那些本來願意留在聖公會以內部作改革的人，也被迫投入分離主義者的陣營。當中不能忍受逼迫的人便紛紛移民到北美洲。然而，這場會議最大的成就是翻譯一本新的聖經，這個新的譯本就是最廣為流傳的「英皇欽定本聖經」(King James Version)，至今仍被英語系國家廣泛使用。
